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更新于 1月6日

AI算法工程師/科學(xué)家(蛋白質(zhì)設(shè)計與優(yōu)化)

2-3萬
  • 上海徐匯區(qū)
  • 經(jīng)驗不限
  • 博士
  • 全職
  • 招1人

職位描述

PyTorchPythonALPHAFOLD DBUNIPROTROSETTA人工智能生物工程學(xué)術(shù)/科研
崗位使命: 開發(fā)并應(yīng)用AI模型,從頭設(shè)計具有特定功能的全新蛋白質(zhì),或優(yōu)化天然蛋白質(zhì)的性能。 核心職責(zé): 1.研發(fā)基于深度學(xué)習(xí)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測、設(shè)計與生成模型。 2.構(gòu)建和訓(xùn)練用于蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、活性、可表達性等屬性預(yù)測的AI模型。 3.與濕實驗室團隊緊密合作,設(shè)計實驗驗證AI設(shè)計的蛋白質(zhì),并迭代優(yōu)化算法。 4.跟蹤并復(fù)現(xiàn)領(lǐng)域內(nèi)最新突破(如AlphaFold3, RFdiffusion, ProteinMPNN等)。 硬技能: 1.AI/ML核心: 精通深度學(xué)習(xí),特別是生成式模型、幾何深度學(xué)習(xí)、圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和變分自編碼器。對自監(jiān)督學(xué)習(xí)、對比學(xué)習(xí)等有深入理解。 2.計算生物學(xué)知識: 深刻理解蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)(一級到四級)、折疊原理、氨基酸物理化學(xué)性質(zhì)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)/配體相互作用。 3.編程與工具: 熟練使用Python及主流深度學(xué)習(xí)框架;熟悉PyTorch Geometric/DGL等圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)庫;熟練使用生物信息學(xué)工具和數(shù)據(jù)庫。 4.數(shù)據(jù)素養(yǎng): 能夠熟練處理和分析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫,如PDB, AlphaFold DB, UniProt等。 軟技能: 1.極強的抽象與建模能力: 能將復(fù)雜的生物物理問題轉(zhuǎn)化為可計算的AI問題。 2.科學(xué)探索精神: 不滿足于應(yīng)用現(xiàn)有工具,有志于在蛋白質(zhì)設(shè)計的基礎(chǔ)算法上實現(xiàn)創(chuàng)新。 3.交叉學(xué)科溝通能力: 能夠清晰地向生物學(xué)家解釋模型原理和設(shè)計邏輯。 加分項: 1.有使用Rosetta, MD模擬等傳統(tǒng)計算工具的經(jīng)驗,并能與AI方法結(jié)合。 2.有蛋白質(zhì)設(shè)計項目相關(guān)經(jīng)驗。

工作地點

上海徐匯區(qū)濱江城開中心

職位發(fā)布者

李女士/人事主管

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上海合生探索科技有限公司是一家以人工智能預(yù)測為核心、合成生物學(xué)為落地為手段的高科技企業(yè),通過AI驅(qū)動的“基因—結(jié)構(gòu)—功能”預(yù)測與高通量驗證,從事新型天然產(chǎn)物分子挖掘、研發(fā)及規(guī)?;镏圃炫c銷售,公司致力于打通“生物合成知識圖譜—人工智能算法—高通量自動化實驗—高產(chǎn)底盤細胞構(gòu)建”全鏈條創(chuàng)新體系,加速天然產(chǎn)物及高價值化合物的高效綠色制造,從而實現(xiàn)AI輔助的天然產(chǎn)物等目標分子的高效、定向挖掘與量產(chǎn),未來將持續(xù)拓展AI+合成生物學(xué)在醫(yī)藥、營養(yǎng)健康、農(nóng)業(yè)及新材料等場景的應(yīng)用邊界,打造全球領(lǐng)先的智能化生物制造平臺。誠意邀請優(yōu)秀精英加入合生團隊!
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